胞内RNA与蛋白质结合情况的验证: RIP

实验意义

研究细胞内RNA与蛋白质的结合情况，有助于了解转录后调控网络的动态过程，发现miRNA的调控靶点，可了解恶性肿瘤以及遗传学疾病等整体水平的RNA变化以及转录后调控网络的变化，应用于病理诊断及科学研究。

实验原理及步骤

RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA Binding Protein Immunoprecipitation, RIP)的基本原理是使用目标蛋白的抗体捕获内源性的RNA-蛋白的复合物，然后通过免疫沉淀的方法把RNA-蛋白复合物一起分离下来，然后通过RT-PCR. RIP-Seq (高通量

测序)或RIP-Chip (microarray) 来鉴定结合的RNA序列。RIP流程如下图

结果展示：

实验周期及交付标准

1.实验周期: 1-3个月

2.交付标准: RIP鉴定结果报告、分析报告、实验报告(试剂、耗材、实验步骤)、

原始数据等

需确认的信息

1.目的基因与蛋白信息。

2.是否提供抗体

3.样本分组及分析要求

参考文献

[1] Gagliardi M, Matarazzo M R. RIP: RNA Immunoprecipitation[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480:73.

[2] Meyer K，K?Ster T，Nolte C . et al. Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7[J] Genome Biology, 2017, 18(1):204.

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