AxyPrep 无内毒素质粒大量试剂盒
本试剂盒采用 SDS 碱裂解法,结合 DNA 制备膜选择性吸附 DNA。同时采用特殊溶液(Buffer ETR 和 Buffer PF)有效去除内毒素,可从 80-200 ml 细菌培养物中提取出多至 500 礸 高纯度质粒 DNA,其内毒素水平控制在 0.1 EU/礸 以下。
一、 试剂盒组成、贮存、稳定性
| Cat. No. | AP-MX-EP-2 | AP-MX-EP-10 | AP-MX-EP-25 | |||
| 制备次数 | 2 preps | 10 preps | 25 preps | |||
| 制备管(Maxiprep column) |
| 2 |
| 10 |
| 25 |
| 大量滤器(Maxiprep syringe filter) |
| 2 |
| 10 |
| 25 |
| RNase A | 48 µl | 270 µl | 700 µl | |||
| Buffer S1 | 24 | ml | 115 | ml | 285 | ml |
| Buffer S2 | 24 | ml | 115 | ml | 285 | ml |
| Buffer S3K | 24 | ml | 115 | ml | 285 | ml |
| Buffer B | 24 | ml | 115 | ml | 285 | ml |
| Buffer W1 | 3 | ml | 160 | ml | 350 | ml |
| Buffer W2 concentrate | 15 | ml | 66 | ml | 150 | ml |
| ET-free water (70% Ethanol) | 1.8 | ml | 7.5 | ml | 18 | ml |
| Eluent A | 8 | ml | 30 | ml | 70 | ml |
| Buffer ETR | 10 | ml | 50 | ml | 120 | ml |
| Buffer PF | 3 | ml | 13 | ml | 30 | ml |
| 说明书 |
| 1 |
| 1 |
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RNase A:50 mg/ml,室温可贮存 6 个月,长期贮存于-20℃。
Buffer S1:细菌悬浮液。加入 RNase A 后,混合均匀,4℃贮存。
Buffer S2:细菌裂解液(含 SDS/NaOH),室温密闭贮存。
Buffer S3K:中和液,室温密闭贮存。
Buffer B:DNA 结合溶液,室温密闭贮存。
Buffer W1:洗涤液,室温密闭贮存。
Buffer W2 concentrate:去盐液。使用前,按试剂瓶上的体积加入无水乙醇(可用无水乙醇或 95%
乙醇)。混合均匀,室温密闭贮存。
ET-free water (70% Ethanol):使用前,按试剂瓶上的体积加入无水乙醇(可用无水乙醇或 95%
乙醇)。混合均匀,室温密闭贮存。
Eluent A:洗脱液。室温密闭贮存。
Buffer ETR:内毒素去除液。室温密闭贮存。
二、 注意事项
1.细菌过量将影响细菌裂解、质粒 DNA 的释放,导致内毒素含量过高。
2.步骤 3 和步骤 4 的操作必须温和。剧烈摇晃将导致基因组 DNA 的污染。但混合必须充分,否则影响得率。
3.在加入 Buffer S3K 时,蛋白质和基因组 DNA 形成粘稠的白色絮状沉淀,必须充分混合均匀,使凝集块中间也得到充分中和凝结。
4.Buffer S2、Buffer S3K、Buffer B 和 Buffer W1 含刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套和防护眼镜,避免沾染皮肤、眼睛和衣物,谨防吸入口鼻。若沾染皮肤、眼睛时,要立即用大量清水或生理盐水冲洗,必要时寻求医疗咨询。
三、 实验准备
1.*次使用前,RNase A 全部加入 Buffer S1 中,4℃贮存。
2.*次使用前,Buffer W2 concentrate 中加入体积的无水乙醇。
3.*次使用前,ET-free water (70% Ethanol)中加入体积的无水乙醇。使用前置于-20℃预冷。
4.使用前,检查 Buffer S2 是否出现沉淀,如出现沉淀,应于 37℃温浴加热溶解并冷却至室温后使用。
5.Eluent A 在 65℃预热后使用,有利于提高质粒得率。
6.Buffer S3K、Buffer B 和 Buffer ETR 使用前置于 4℃预冷。
7.准备无核酸和核酸酶污染的 Tip 头、50ml 离心管。
8.水平离心机(转速可达到 4,000×g)及冷冻离心机(转速可达到 8,000×g)
9.准备 56℃水浴。
Buffer PF:分相缓冲液。室温密闭贮存。
四、 操作步骤
AxyPrep无内毒素质粒大量试剂盒
1.取 80-200 ml 在 LB 培养基中培养过夜的菌液(若使用丰富培养基,菌液体积应减半或更少),3,000 ×g 离心 8 min,弃上清。将离心管倒置于纸巾上 1 min,除尽上清。
一般过一夜培养的菌液 OD600 在 2.0-4.0 之间。若菌液 OD600 >4,菌量需减少。
2.加 10 ml Buffer S1,悬浮细菌沉淀,悬浮需均匀,不应留有小的菌块。
确认 Buffer S1 中已加入 RNase A。
3.加 10 ml Buffer S2,温和并充分地上下翻转混合均匀使菌体充分裂解,直至形成透亮的溶液。此步骤不宜超过 5 min。
Buffer S2 使用后立即盖紧瓶盖,以免空气中的 CO2 中和 Buffer S2 中的 NaOH,降低溶菌效率。
避免剧烈摇晃,否则将导致基因组 DNA 污染。
此步骤不宜超过 5 min。
4.加 10 ml 4℃预冷的 Buffer S3K,温和并充分地上下翻转混合,直至溶液颜色均一并形成紧实的凝集块,室温放置 5 min。
加入 Buffer S3K 后应立即混合,以避免形成局部的凝结块。
避免剧烈摇晃,否则将导致基因组 DNA 污染。
5.加 10 ml 4℃预冷的 Buffer B,温和并充分地上下翻转混合 10 次,8,000×g 离心(4℃)10 min。
步骤 6-9 可以选择离心法或负压法。
A.离心法:
6A. 先将大量制备管放入 50 ml 离心管中。吸取步骤 5 中的混合液,转移到大量滤器(Maxiprep
syringe filter)中。
7A. 插入推杆,垂直向下缓慢将滤液推注至大量制备管中,≥6,000×g 离心 5 min。 8A. 弃滤液,加 12 ml Buffer W1 至制备管中,≥6,000×g 离心 5 min。
9A. 弃滤液,加 14 ml Buffer W2 至制备管中,≥6,000×g 离心 5 min。
确认在 Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上的体积加入无水乙醇。
B.负压法:
6B. 正确连接负压装置,将大量制备管插到负压装置的插口上。
7B. 吸取步骤 5 中的上清液,转移到大量滤器中,插入推杆,垂直向下缓慢将滤液推注至大量制备管中,开启并调节负压至-25 ~ -30 英寸汞柱,缓慢吸走管中溶液。
8B. 保持负压,加 12 ml Buffer W1,吸尽管中溶液。
9B. 保持负压,加 14 ml Buffer W2,吸尽管中溶液。
确认在 Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上的体积加入无水乙醇。
10.再在大量制备管中加 4 ml Buffer W2,≥6,000×g 离心 5 min。
11.将制备管置于另一洁净 50 ml 离心管中,在制备管膜中央加 2 ml Eluent A,室温静置 5 min,≥6,000
×g 离心 5 min 收集质粒 DNA。
将 Eluent A 加热至 65℃将提高洗脱效率。
12.弃制备管。在滤液中加入 4 ml 预冷的 Buffer ETR,混合均匀。
如果 Buffer ETR 浑浊,于冰上静置,直至溶液变得清亮;如果分层,则混合均匀。
13.加入 1 ml Buffer PF,混合均匀。
*溶液可能会出现微弱的浑浊现象,此为正常现象。
14.置于 56°C 孵育 8 min。室温 4,000×g 离心 5 min。
孵育后溶液将出现大量乳白色沉淀,否则延长孵育时间。
孵育后溶液有可能出现分层现象,此为正常现象。
此步骤的离心必须使用吊篮式(swing-out rotor)离心机或其他水平离心机
15.取无色上相至 50 ml 离心管中,加入 0.8 倍体积异丙醇(如:取得 6 ml 无色上相,则加入 4.8 ml 异丙醇),混合均匀。室温静置 10 min。8,000×g 离心 10 min。
16.尽可能弃尽上清。加入 2 ml 预冷的 ET-free water(70% Ethanol),洗涤沉淀,8,000×g 离心 5 min。
ET-free water(70% Ethanol)使用前确定已加入体积的无水乙醇。
AxyPrep无内毒素质粒大量试剂盒
17.尽可能弃尽上清。在超净台中干燥 10-15 min。
管壁上残留液体可短暂离心后吸弃。
18.加入 500 祃 Eluent A 或无内毒素水溶解质粒 DNA。
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